DsDD cDNA Subtraction Kit Wako双链特异性直接消化cDNA削减试剂盒
Simple and quickenrichment of specifically expressed genes
TIBCO削减法杂交法是一种利用组织特异性显现,鉴定基因的有效方法之一。迄今为止有各种各样不同的方法被提出,然而,无论哪种方法的操作都较为烦杂且作业工序多,需要时间和高技术。而且,cDNA Library 不能用于作为启发材料,因而每次都不得不用mRNA准备Tester及Driver cDNA。
DsDD(Duplex-specific DirectDigestion)cDNA Subtraction Kit Wako是以cDNA library 的调制为基础,运用减去法调制Tester 及Driver cDNA。再利用Tester及cDNA 显现组织的非特异性,形成高品质的基因同伴。在二条链的特异性DNA核酸酶存在的情况下,利用Duplex-specific nuclease,分解杂化的DNA。之后,利用ExonucleaseⅠ分解除去在Tester cDNA中特异显现的残留Drive cDNA,以实现cDNA高效浓缩。
在解析癌细胞组织特异性机能和性质时,Tester cDNA 由癌细胞组织调制,Driver cDNA由正常细胞组织调制,浓缩来自基因的cDNA,可显现癌细胞组织的特异性。DsDD cDNA Subtraction Kit Wako中的cDNA Library 可用于作为起动材料,此方法的全部工序可在2天完成,是划时代的技术。
【试剂盒内容】
● LambdaExonuclease | 5µl X 1支 |
● 10 X LambdaExonuclease Buffer | 25µl X 1支 |
● 4 XHybridization Buffer | 25µl X 1支 |
● Duplex—specific nuclease | 5µl X 1支 |
● 2 XDuplex-specific nuclease Buffer | 25µl X 1支 |
● ExonucleaseⅠ | 5µl X 1支 |
● 10 XExonuclease I Buffer | 25µl X 1支 |
● Ethachinmate | 50µl X 1支 |
● StopSolution | 50µl X 1支 |
● 3mol/SodiumAcetate, PH5.2 | 200µl X 1支 |
● 使用手册 | 1本 |
【试剂盒原理】
注意Tester cDNALibrary及Driver cDNALibrary。
对于cDNA媒介物,Tester使用同一方向插入的cDNA Library。
1. TesterLibrary(异常)→DNA放大 →由Library 放大的Tester dsDNA.
Driver Library(正常)→DNA放大→由Library放大的Diver dsDNA.
2. Tester DNA的调制:
使用仅一侧磷酸化的cDNA程序库,用启发剂进行DNA放大,经Lambda Exonuclease处理,调制出1条链cDNA。
注1) TestercDNA放大。
DNA放大时,对附带磷酸的5ˊ末端使用启发剂。
注2) LambdaExonuclease 处理。
识别2条链DNA的5ˊ磷酸末端,由5ˊ→3ˊ方向分解。如果无法形成高品质的Tester同伴,可适当提高减去法效率。
3. Driver DNA的调制:
使用cDNA程序库进行DNA放大,将multi-Croning两侧的部分部位用限制酶处理。
注3)制限酶处理:
除去两端的接合部分,以防止杂交时的差错及杂化。
4. 杂交:
Tester cDNA和Driver cDNA在68℃情况下反应16--20小时。(混合比为1:200)过量的Driver cDNA与除特异性基因以外的Tester cDNA大部分形成dsDNA。
注4)热变性后,Tester ss cDNA 和Driver ds cDNA不进行杂交。
5. DSN处理:
利用DSN作用于2条链的特异性,分解除去杂化形成的2条链cDNA。
注5)进行高特异性反应,其反应温度高于68℃。
6. DNA放大
7. Exonuclease I 处理
利用Exonuclease I 分解除去未形成杂化的残留Driver ss cDNA。使用酶切断特异性1条链DNA。除特异性基因以外的一条链状态全部分解。自实验开始起2天内,即可得到高效率的Subtracted cDNA。
产品编号 | 品名 | 容量 |
294-62001 | DsDDcDNA Subtraction kitWako | 5次用 |